Comprendre le microbiome intestinal de votre animal de compagnie
Le microbiome intestinal — la vaste communauté de bactéries, champignons, virus et autres micro-organismes vivant dans le tractus gastro-intestinal — est devenu l'un des sujets les plus importants de la médecine vétérinaire au cours de la dernière décennie. Chez les chiens et les chats, comme chez les humains, le microbiome joue un rôle central dans la digestion, la régulation du système immunitaire, l'absorption des nutriments, et même la fonction neurologique via l'axe intestin-cerveau. Lorsque cette communauté microbienne est saine et équilibrée, elle soutient le bien-être général. Lorsqu'elle est perturbée, les conséquences peuvent s'étendre bien au-delà de l'intestin lui-même.
Qu'est-ce qu'un microbiome sain ?
Un microbiome intestinal équilibré chez les chiens et les chats remplit une remarquable gamme de fonctions. Les bactéries bénéfiques décomposent les fibres alimentaires en acides gras à chaîne courte, qui nourrissent les cellules tapissant la paroi intestinale et aident à maintenir la barrière intestinale. Une barrière intestinale saine empêche les bactéries pathogènes et leurs toxines de s'échapper dans la circulation sanguine — un état connu sous le nom de perméabilité intestinale, ou familièrement « l'intestin qui fuit ».
Le microbiome joue également un rôle central dans l'éducation immunitaire, en entraînant le système immunitaire à distinguer les agents inoffensifs des agents nuisibles. Environ 70 pour cent des cellules immunitaires du corps sont situées dans ou à proximité de l'intestin. Les perturbations du microbiome au début de la vie ont été associées à un risque accru de conditions allergiques et auto-immunes. De plus, les bactéries intestinales produisent certaines vitamines B et de la vitamine K, et influencent l'efficacité avec laquelle le corps absorbe les nutriments des aliments.
Prébiotiques vs probiotiques : une distinction importante
Ces deux termes sont souvent confondus, mais ils font référence à des choses très différentes :
- Les probiotiques sont des micro-organismes vivants — généralement des bactéries — qui, lorsqu'ils sont administrés en quantités adéquates, procurent un bénéfice pour la santé à l'organisme hôte. En termes simples, ils ajoutent des microbes bénéfiques à l'intestin. Les bactéries probiotiques couramment utilisées dans les suppléments pour animaux de compagnie incluent Enterococcus faecium, Lactobacillus acidophilus, les espèces Bifidobacterium et Bacillus coagulans.
- Les prébiotiques sont des composés alimentaires — généralement des types spécifiques de fibres — qui ne sont pas digérés par l'organisme hôte mais alimentent plutôt sélectivement et stimulent la croissance des bactéries bénéfiques déjà présentes dans l'intestin. Les prébiotiques courants incluent les fructo-oligosaccharides (FOS), l'inuline et certaines formes de pectine et de psyllium.
Une analogie utile : si le microbiome intestinal est un jardin, les probiotiques sont les graines (ajoutant de nouvelles plantes) tandis que les prébiotiques sont l'engrais (aidant les plantes existantes à s'épanouir). Les deux peuvent être précieux, mais ils fonctionnent différemment et ne sont pas interchangeables. Certains produits sont décrits comme synbiotiques, combinant à la fois des prébiotiques et des probiotiques dans une seule formulation.
Dysbiose : quand le microbiome s'en va mal
La dysbiose fait référence à un déséquilibre dans la communauté microbienne intestinale — généralement une réduction de la diversité et des bactéries bénéfiques accompagnée d'une prolifération d'organismes potentiellement nuisibles. Chez les chiens et les chats, la dysbiose est associée à un large éventail de conditions, notamment la diarrhée aiguë et chronique, la maladie inflammatoire de l'intestin (MII), l'entéropathie réactive aux aliments, l'obésité, les maladies hépatiques, et même les conditions cutanées.
Les causes courantes de dysbiose incluent :
- Le traitement antibiotique — même les traitements courts peuvent causer une perturbation significative et prolongée
- Les changements alimentaires, en particulier les changements soudains entre les croquettes
- Les infections gastro-intestinales, y compris les causes bactériennes, virales et parasitaires
- Le stress chronique, qui peut altérer la motilité intestinale et les populations microbiennes
- Les conditions inflammatoires sous-jacentes affectant le tractus gastro-intestinal
Le diagnostic de dysbiose peut être étayé par des tests du microbiome fécal, disponibles par l'intermédiaire de laboratoires vétérinaires spécialisés. Cependant, l'interprétation nécessite une expertise, et un résultat positif de dysbiose n'est pas en soi un diagnostic de toute cause sous-jacente spécifique — il signale un déséquilibre qui doit être compris dans un contexte clinique.
Antibiotiques et perturbation du microbiome
Les antibiotiques sont parmi les perturbateurs les plus puissants du microbiome intestinal. Bien qu'ils soient souvent essentiels et vitaux, les antibiotiques à large spectre en particulier ne font pas de distinction entre les bactéries pathogènes et bénéfiques. Des études chez les chiens ont montré qu'un seul traitement aux antibiotiques couramment utilisés tels que le métronidazole ou l'amoxicilline-acide clavulanique peut modifier considérablement le microbiome intestinal, avec des effets durables des semaines à des mois. Dans certains cas, certaines populations microbiennes peuvent ne pas se rétablir complètement.
Cela ne signifie pas que les antibiotiques doivent être évités lorsqu'ils sont cliniquement indiqués — ils doivent absolument être utilisés lorsqu'ils sont nécessaires. Cependant, cela soutient l'approche consistant à utiliser l'antibiotique le plus ciblé possible, pour la durée effective la plus courte, et seulement lorsque c'est véritablement nécessaire. Cela soutient également l'utilisation de suppléments probiotiques pendant et après les traitements antibiotiques pour aider à soutenir la récupération microbienne, bien que la base de preuves pour des produits et des protocoles spécifiques soit encore en développement.
Le métronidazole en particulier, malgré son utilisation historiquement très courante pour les signes gastro-intestinaux chez les chiens et les chats, s'avère de plus en plus causer une dysbiose significative et est désormais recommandé moins librement comme traitement de première ligne pour la diarrhée sans complications en médecine vétérinaire.
Produits probiotiques pour les animaux de compagnie
Plusieurs produits probiotiques spécifiquement vétérinaires sont disponibles et disposent de certaines preuves. FortiFlora (fabriqué par Purina) est l'un des plus largement étudiés, contenant Enterococcus faecium SF68, une souche démontrée capable de survivre au transit dans le tractus gastro-intestinal et de soutenir la qualité des selles chez les chiens et les chats souffrant de diarrhée. Il est également très appétent, ce qui facilite l'administration.
Protexin et les produits multi-souches similaires offrent une gamme plus large d'espèces bactériennes dans chaque dose, ce qui peut fournir un effet d'ensemencement plus diversifié, bien que les données cliniques comparatives entre les produits soient limitées. Lorsque vous choisissez un probiotique pour votre animal de compagnie, recherchez des produits spécifiquement formulés et testés pour une utilisation chez les animaux, car les produits probiotiques humains contiennent des souches qui peuvent ne pas coloniser
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